Es ist deine ganz persönliche Entscheidung was du mit dem Mopped tust. Entweder als modified bike aufbauen, komplett restaurieren und in den Neuzustand versetzen oder so lassen wie sie ist. Oder irgendwas dazwischen.
Ich an deiner Stelle würde damit einfach das machen was mir am meisten Spass macht. Das Mopped ist eines von x. Es ist kein historisches Kulturgut das jetzt erhalten werden muss und sowieso sauteuer ist.
Mache einfach das damit was dir Spass macht. Wenn du Roststellen sanieren musst dann kommst du wohl um eine Lackierung nicht rum. Oder du besserst die Stellen mit einer Spraydose selber aus.
Egal in was das Projekt enden soll, den Rost würde ich ernst nehmen und den radikal und nachhaltig beseitigen. Der Rest ist wirklich jedem persönlichen Gusto überlassen.
Patina hat ihren besonderen Reiz und Charme. Aber die Patina sollte in das Gesamtbild passen und man sollte sich deswegen nicht von unabdingbaren Reparaturen abhalten lassen.
Ich würde, wenn ich an deiner Stelle wäre, wohl den Rahmen in eine Profiwerkstatt schicken, reparieren und gleich lackieren lassen. Die Kosten dürften in einem vernünftigen Rahmen bleiben. Den Rest kannst du ja selber erledigen.
Alle Teile gründich vom schmutz befreien und die Technik wieder auf Vordermann bringen. Dann hast du sicher ein tolles Bike.
Aber jeder sieht das natürlich anders. Ist ja auch kein Problem.
BTW:
Hier ein Bild von einer Restauraton bei Sandlander. Auch durch eine komplett Restauration und nachfolgende Neulackierung muss ein Fahrzeug noch lange nicht seinen Charme verlieren:
Die haben hier garantiert nicht mit sog. Rostumwandler hantiert!
, dann würde ich dir raten, die Cub optisch unangetastet zu lassen. 
Sehe ich genau so. Mit einer halbherzigen Lösung könnte ich ohne Not nicht zufrieden sein, , würd mich schämen damit bei Tageslicht unterwegs zu sein.